Tra i compiti principali dell'Unità Stato maggiore (USM) figurano il coordinamento con gli altri servizi federali, il disbrigo di questioni giuridiche, il controlling e le finanze, la pianificazione, la comunicazione, la gestione delle informazioni e i servizi centrali quali la segreteria.
L'USM coadiuva la direzione e le altre unità nello svolgimento dei loro compiti, assicura il perfetto funzionamento delle procedure in seno all'AFS e funge da interfaccia con partner nazionali e internazionali.